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设施生态农业及配套技术是在设施工程的基础上通过以有机肥料全部或部分替代化学肥料（无机营养液）、以生物防治和物理防治措施为主要手段进行病虫害防治、以动、植物的共生互补良性循环等技术构成的新型高效生态农业模式。其典型模式与技术如下：
设施清洁栽培模式及配套技术
主要内容：（1）设施生态型土壤栽培。通过采用有机肥料（固态肥、腐熟肥、沼液等）全部或部分替代化学肥料，同时采用膜下滴灌技术，使作物整个生长过程中化学肥料和水资源能得到有效控制，实现土壤生态的可恢复性生产；（2）有机生态型无土栽培。通过采用有机固态肥（有机营养液）全部或部分替代化学肥料，采用作物秸秆、玉心芯、花生壳、废菇渣以及炉渣、粗砂等作为无土栽培基质取代草炭、蛭石、珍珠岩和岩棉等，同时采用滴灌技术，实现农产品的无害化生产和资源的可持续利用；（3）生态环保型设施病虫害综合防治模式。通过以天敌昆虫为基础的生物防治手段以及一批新型低毒、无毒农药的开发应用，减少农药的残留；通过环境调节、防虫网、银灰膜避虫和黄板诱虫等离子体技术等物理手段的应用，减少农药用量，使蔬菜品种品质明显提高。
技术组成：（1）设施生态型土壤栽培技术。主要包括有机肥料生产加工技术，设施环境下有机肥料施用技术，膜下滴灌技术；栽培管理技术等；（2）有机生态型无土栽培技术。主要包括有机固态肥（有机营养液）的生产加工技术，有机无土栽培基质的配制与消毒技术，滴灌技术，有机营养液的配制与综合控制技术，栽培管理技术等；（3）以昆虫天敌为基础的生物防治技术；（4）以物理防治为基础的生态防病、土壤及环境物理灭菌，叶面微生态调控防病等生态控病技术体系等。
通过温室工程将蔬菜种植、畜禽（鱼）养殖有机地组合在一起而形成的质能互补、良性循环型生态系统。目前，这类温室已在中国辽宁、黑龙江、山东、河北和宁夏等省市自治区得到较大面积的推广。
该模式目前主要有两种形式：（l）温室“畜－菜”共生互补生态农业模式。主要利用畜禽呼吸释放出的CO2。供给蔬菜作为气体肥料，畜禽粪便经过处理后作为蔬菜栽培的有机肥料来源，同时蔬菜在同化过程中产生的O2等有益气体供给畜禽来改善养殖生态环境，实现共生互补；（2）温室“鱼－莱”共生互补生态农业模式。利用鱼的营养水体作为蔬菜的部分肥源，同时利用蔬菜的根系净化功能为鱼池水体进行清洁净化。
技术组成：（1）温室“畜－菜”共生互补生态农业模式主要包括“畜－菜”共生温室的结构设计与配套技术，畜禽饲养管理技术，蔬菜栽培技术，“畜－菜”共生互补合理搭配的工程配套技术，温室内NH3、H2S等有害气体的调节控制技术；（2）温室“鱼菜”共生互补生态农业模式主要包括：“鱼－菜”共生温室的结构与配套技术，温室水产养殖管理技术，蔬菜栽培技术，“鱼－菜”共生互补合理搭配的工程配套技术，水体净化技术。
设施立体生态栽培模式及配套技术
该模式目前有三种主要形式：（l）温室“果－莱”立体生态栽培模式。利用温室果树的休眠期、未挂果期地面空间的空闲阶段，选择适宜的蔬菜品种进行间作套种；（2）温室“菇－莱”立体生态培养模式，通过在温室过道、行间距空隙地带放置食用菌菌棒，进行“菇－菜”立体生态栽培，食用菌产生的CO2可作为蔬菜的气体肥源，温室高温高湿环境又有利食用菌生长；（3）温室“莱－菜”立体生态栽培模式。利用藤式蔬菜与叶菜类蔬菜空间上的差异，进行立体栽培，夏天还可利用藤式蔬菜为喜阴蔬菜遮阳，互为利用。
技术组成：（1）设施工程技术：包括温室的选型，结构设计，配套技术的应用，立体栽培设施的工程配套等；（2）脱毒抗病设施栽培品种的选用；（3）“果－菜”、“菇－菜”、“菜－菜”品种的选用与搭配；（4）立体栽培设施的水肥管理技术；（5）病虫害综防植保技术。
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